2012 yılında, Digimon Adventure: Last Evolution Kizuna'daki olayların ardından, erken yetişkinlik dönemindeki DigiDestined (Daisuke, Miyako, Iori, Takeru Takashi, Hikari ve Ken) yeni sorumluluklarını Digimon ortaklarıyla uzlaştırmak zorundadır. Ancak gizemli bir genç adam olan Rui Owada ortaya çıkar ve Digimon-Ukkomon'la ortak olan ilk insan olduğunu iddia eder. Rui gerçekten ilk DigiDestined olabilir mi?