Paddington, şu anda Emekli Ayılar Evi'nde yaşayan sevgili Teyzesi Lucy'yi ziyaret etmek için Peru'ya gider. Brown Ailesi de arkalarındayken, bir gizem onları Amazon yağmur ormanlarında ve Peru'nun dağ zirvelerine doğru beklenmedik bir yolculuğa sürüklediğinde heyecan verici bir macera başlar.